Le flanc est du plateau fait partie du site Natura 2000, intitulé «Vallées et coteaux xérothermiques des Couzes et des Limagnes». Ce site comprend essentiellement le Puy Mardou et le sillon basaltique qui le prolonge vers l’est jusqu’au village de Gergovie. Il est caractérisé par la présence de pelouses sèches et très sèches (xériques).
Deux sortes de pelouses existent :
- les pelouses xériques, arides installées sur des roches volcaniques, pépérites et basaltes. Il s’agit d’un milieu extrême avec des plantes adaptées à la sécheresse, certaines d’entre elles étant classées parmi les espèces rares. Cet habitat est d’intérêt prioritaire.
- Les pelouses sèches sur marno-calcaires sont formées essentiellement de graminées ; elles sont progressivement envahies par des arbustes, prunelliers et baguenaudiers. Elles présentent un intérêt communautaire pour leur conservation.
Une quarantaine d’oiseaux, oiseaux nicheurs et oiseaux visiteurs, ont été inventoriés.
Parmi les rapaces, outre la Buse variable et le Milan noir qui sont des espèces communes, on peut observer à partir du printemps le Circaëte Jean-le-Blanc, un rapace de grande taille (près de 2 m d’envergure !) qui se nourrit exclusivement de reptiles (serpents, lézards) ; ce migrateur hiberne en Afrique tropicale, il revient en Auvergne pour se reproduire. Les Passereaux nichent dans les buissons et les bois d’acacias : citons le Bruant jaune, l’Alouette lulu, le Pouillot véloce, le Pipit des arbres, le Traquet pâtre …
Parmi les arbustes et buissons, on rencontre l’Eglantier, l’Aubépine,
le Chèvrefeuille,
le Cornouiller sanguin, le Baguenaudier, le Prunellier…
Près de 300 espèces de plantes ont été recensées, dont 19 assez rares à très rares. Citons l’Andosace d’Occident, l’Astragale de Montpellier, l’Hélianthème des Apennins ou la Carline à feuilles d’acanthe. Les Orchidées, Orchis et Ophrys, sont relativement nombreuses (une dizaine d’espèces) : Orchis bouc, Orchis pourpre, Orchis pyramidal, Ophrys abeille, Ophrys frelon …
Le Puy Mardou est l’un des sites les plus riches en papillons ; 111 espèces de Lépidoptères y vivent. Le site recèle Saturnia pyri, le plus grand papillon de France. D’autres insectes classiques dans les milieux secs se rencontrent communément comme la Mante religieuse et l’Ephippigère.